Historia Liceum Ogólnokształcącego w Szczytnie zaczyna się w 1945 roku, kiedy to zostaje powołane do życia Państwowe Koedukacyjne Ogólnokształcące Gimnazjum, a w październiku tego roku (właśnie minęło 75 lat), odbyło się pierwsze posiedzenie Rady Pedagogicznej. Od 1986 roku szkoła nosi imię Jana III Sobieskiego. Szkołę ukończyło blisko 10 tysięcy osób, wśród nich - Krzysztof Klenczon.
Szkoła przystąpiła do programu "Dialog pokoleń" w 2020 r.